Si è svolta, nella notte del 20 maggio, l'edizione 2006 della Notte dei Musei. Anche quest'anno la Soprintendenza del Mare nella sua sede di via Lungarini, ha ospitato eventi che hanno visto la partecipazione di numerosi visitatori. Nell'atrio di Palazzetto Mirto si sono esibiti Marco Mazzamuto e Laura Campisi che hanno proposto il repertorio di Billie Holiday. Nelle scuderie del palazzetto il maestro Provenzano ha esposto i modelli di imbarcazioni tipiche della marineria siciliana. I visitatori hanno potuto assistere alla proiezione di due filmati d'epoca sulla pesca del pesce spada e sulla costruzione delle barche tradizionali siciliane.